History of Biological Databases, Their Importance, and Existence in Modern Scientific and Policy Context
Type
Journal article
Language
English
Date issued
2025
Author
Danielewski, Mikołaj
Nowak, Jan Krzysztof
Walkowiak, Jarosław
Wielgus, Karolina
Faculty
Wydział Rolnictwa, Ogrodnictwa i Biotechnologii
PBN discipline
biotechnology
Journal
Genes
ISSN
2073-4425
Web address
Volume
16
Number
1
Pages from-to
art. 100
Abstract (PL)
Wraz z rozwojem technologii sekwencjonowania genomu, ilość generowanych danych znacznie wzrosła w ciągu ostatnich dwóch dekad. Obfitość informacji o sekwencjach cyfrowych (DSI) zapewniła możliwości badawcze, poprawiła nasze zrozumienie genomu i doprowadziła do odkrycia nowych rozwiązań w przemyśle i medycynie. Postawiło to również pewne wyzwania, tj. jak przechowywać i obsługiwać takie ilości danych. To, w połączeniu z potrzebą wygody, współpracy międzynarodowej i możliwości niezależnej walidacji, doprowadziło do powstania licznych baz danych. Zgodnie z ideą, że dane uzyskane z funduszy publicznych powinny być dostępne publicznie, otwarty dostęp stał się dominującym sposobem akcesji. Jednak rosnąca popularność komercyjnych testów genetycznych przywraca temat niewłaściwego wykorzystania danych i prywatności pacjentów. Na poprzedniej Konferencji Narodów Zjednoczonych w sprawie Różnorodności Biologicznej (COP15, 2022) poruszono kwestię krajów najsłabiej rozwiniętych, które eksploatują swoje zasoby naturalne, zapewniając jednocześnie DSI, a kraje najbardziej rozwinięte czerpią z tego korzyści. Zaproponowano, że wynagrodzenie finansowe za dane może pomóc w ochronie różnorodności biologicznej. Mając na celu przybliżenie tematu osobom zainteresowanym wykorzystaniem biologicznych baz danych, w niniejszej publikacji przedstawiamy historię biologicznych baz danych, ich niezbędność w dzisiejszym świecie nauki oraz kwestie, które ich dotyczą i ich zawartość, zapewniając jednocześnie kontekst naukowy i polityczny w odniesieniu do Konferencji Narodów Zjednoczonych w sprawie Różnorodności Biologicznej (COP16, 21.10-1.11.24).
Abstract (EN)
With the development of genome sequencing technologies, the amount of data produced has greatly increased in the last two decades. The abundance of digital sequence information (DSI) has provided research opportunities, improved our understanding of the genome, and led to the discovery of new solutions in industry and medicine. It has also posed certain challenges, i.e., how to store and handle such amounts of data. This, coupled with the need for convenience, international cooperation, and the possibility of independent validation, has led to the establishment of numerous databases. Spearheaded with the idea that data obtained with public funds should be available to the public, open access has become the predominant mode of accession. However, the increasing popularity of commercial genetic tests brings back the topic of data misuse, and patient’s privacy. At the previous United Nations Biodiversity Conference (COP15, 2022), an issue of the least-developed countries exploiting their natural resources while providing DSI and the most-developed countries benefitting from this was raised. It has been proposed that financial renumeration for the data could help protect biodiversity. With the goal of introducing the topic to those interested in utilizing biological databases, in this publication, we present the history behind the biological databases, their necessity in today’s scientific world, and the issues that concern them and their content, while providing scientific and policy context in relation to United Nations Biodiversity Conference (COP16, 21.10—1.11.24).
Keywords (PL)
Keywords (EN)
License
CC-BY - Attribution
CC-BY - Attribution Open access date
January 18, 2025