Repository logoRepository logoRepository logoRepository logo
Repository logoRepository logoRepository logoRepository logo
  • Communities & Collections
  • Research Outputs
  • Employees
  • AAAHigh contrastHigh contrast
    EN PL
    • Log In
      Have you forgotten your password?
AAAHigh contrastHigh contrast
EN PL
  • Log In
    Have you forgotten your password?
  1. Home
  2. Bibliografia UPP
  3. Bibliografia UPP
  4. Fungal community diversity in soils under pedunculate oak Quercus robur L. and European beech Fagus sylvatica L. saplings produced with different technologies
 
Full item page
Options

Fungal community diversity in soils under pedunculate oak Quercus robur L. and European beech Fagus sylvatica L. saplings produced with different technologies

Type
Journal article
Language
English
Date issued
2023
Author
Baranowska, Marlena 
Behnke-Borowczyk, Jolanta 
Kartawik, Natalia 
Szmyt, Janusz Stanisław 
Korzeniewicz, Robert 
Faculty
Wydział Leśny i Technologii Drewna
Journal
Sylwan
ISSN
0039-7660
DOI
10.26202/sylwan.2023007
Web address
https://sylwan-journal.pl/apex/f?p=110:10:::::P10_ARTYKUL,P10_NAZWA_PLIKU,P10_ZESZYT_NEW:2023007,13154151179764107%2F2023_02_078au.pdf,2023_2
Volume
167
Number
2
Pages from-to
78-100
Abstract (PL)
Grzyby i organizmy grzybopodobne są istotnymi elementami ekosystemów leśnych. Wpływają one na zdrowotność, wzrost i produktywność roślin. Istotne jest zrozumienie roli zbiorowisk grzybów związanych z gatunkami lasotwórczymi. Celem badań było porównanie struktury zbiorowisk grzybów w glebie spod żywych i martwych korzeni buka zwyczajnego i dębu szypułkowego po− chodzących z rocznej uprawy założonej z sadzonek wyprodukowanych różnymi technologiami. Przyjęto, że saprotrofy i patogeny będą dominować w zbiorowiskach grzybów glebowych pod korzeniami martwych drzew, grzyby mykoryzowe będą dominować w zbiorowiskach grzybów glebowych pod żywymi korzeniami drzew oraz że zbiorowisko grzybów związane z sadzonkami kontenerowymi będzie zdominowane przez grzyby mykoryzowe i będzie bardziej zróżnicowane niż w przypadku sadzonek z gołym korzeniemPróby pochodziły z rocznej uprawy z leśnictwa Wielisławice (51°1446,0N 18°0615,6 ). Materiał sadzeniowy pochodził ze szkółki Dobrygość. Pobrano 15 próbek gleby (po 0,5 kg każda) z wariantów: KQL – żywe dęby ze szkółki kontenerowej; KQD – martwe dęby ze szkółki kontenerowej; NQL – żywe dęby z nagim systemem korzeniowym; NQD – martwe dęby z nagim systemem korzeniowym; KFL – żywe buki ze szkółki kontenerowej; KFD – martwe buki ze szkółki kontenerowej; NFL – żywe buki z nagim systemem korzeniowym; NFD – martwe buki z nagim systemem korzeniowym. Łącznie pobrano 120 próbek. Ekstrakcję DNA przeprowadzono przy pomocy zestawu DNeasy PowerSoil Kit. Identyfikację gatunków grzybów wykonano przy użyciu regionu rDNA ITS1, 5.8S. Analizę prze− prowadzono z użyciem starterów ITS1FI2 – 5’ GAA CCW GCG GAR GGA TCA 3’ oraz 5.8S– 5’ CGC TGC GTT CTT CAT CG 3’. Otrzymane produkty PCR zsekwencjonowano, stosując technologię Illumina SBS. Wyniki poddano analizie bioinformatycznej i statystycznej. Sekwencje porównano z sekwencjami referencyjnymi zdeponowanymi w bazie danych NCBI przy użyciu algorytmu BLAST. Różnorodność definiowano jako liczbę gatunków w próbce. Przeprowadzono analizę statystyczną różnorodności biologicznej oraz dokonano oceny przeżywalności drzew w okresie uprawy. Do wizualizacji składu zbiorowisk grzybów wykorzystano niemetryczne skalowanie wielowymiarowe (NMDS) ze wskaźnikiem odmienności Braya−Curtisa. Przeprowadzono analizę podobieństwa funkcją anosim w pakiecie wegańskim (R Core Team 2021). W celu określenia, które gatunki grzybów można uznać za gatunki wskaźnikowe związane z określoną grupą sadzo− nek na podstawie typu produkcji, zastosowano funkcję multipatt w pakiecie indicspecies (R Core Team 2021). Kolejnym etapem badań była analiza chemiczna gleby (tło badawcze) (tab. 4). We wszystkich analizowanych próbach zidentyfikowano 1293 taksony i uzyskano łącznie 63 321 sekwencji. W zbiorowiskach grzybów dominowały taksony z typów Ascomycota i Basidiomycota (ryc. 1 i 2). W analizowanych próbach najwięcej było grzybów mykoryzowych (58,43%), saprotrofów (20,96%) i patogenów (19,70%) (ryc. 3). W zbiorowiskach związanych z żywymi drzewami dominowały grzyby mykoryzowe. Saprotrofy dominowały w glebie związanej z martwymi drze− wami (ryc. 3). Zbiorowisko grzybów związane z dębem było znacznie bardziej zróżnicowane i liczniejsze niż zbiorowisko związane z bukiem. W zbiorowisku grzybów związanych z martwymi drzewami dominowały grzyby rozkładające drewno (saprotrofy), natomiast w przypadku sadzo− nek żywych dominowały grzyby mykoryzowe. Wśród saprotrofów najczęściej izolowanymi grzy− bami były Hyaloscypha spp., Deconica phyllogena, Mycena spp., Dictyochaeta sp. i Paraphaeosphaeria neglecta. Nie stwierdzono różnicy między udziałem patogenów w zbiorowisku drzew żywych i martwych. Różnorodność taksonomiczna grzybów zależała głównie od gatunków sadzonek drzew (tab. 1−3, suplement). Zbiorowiska grzybów drzew z produkcji kontenerowej były bardziej zróżnicowane niż produkowane w technologii tradycyjnej. Średnia przeżywalność drzew w doświadczeniu po pierwszym sezonie wegetacyjnym wy− niosła 88,48% (ryc. 4). Analiza podobieństw wykazała, że zbiorowiska grzybów wykazywały istotne statystycznie różnice (R=0,406, p=0,019) pomiędzy sadzonkami różnych gatunków drzew i różnymi technologiami produkcji (ryc. 5). Fusarium oxysporum był istotnie statystycznie związany z sadzonkami kontenerowymi. Wyniki badań wskazują, że należy rozważyć szersze wykorzystanie sadzonek kontenerowych dębu szypułkowego do odnowień i zalesień ze względu na ich większą przeżywalność niż sadzonek z nagim systemem korzeniowym.
Abstract (EN)
Fungi constitute a vital element of forest biological diversity. A deeper understanding of their role in the forest crops can impact the modification of forest management. Hence the need to understand the role of fungal in community of forest crops better. The aim of this study was to investigate fungal communities associated with soil under asymptomatic and dead two−year−old saplings of Quercus robur and Fagus sylvatica that were produced as bare−root and containerized seedlings. The fungal communities in soil were analysed by next−generation sequencing (Illumina SBS technology) of internal transcribed spacer (ITS) region. In all the samples, a total of 1293 taxa were identified (including 1137 fungi taxa) and a total of 63,321 sequences were obtained. The relative abundance of Ascomycota (58.08%) was the highest, followed by, Basidiomycota (16.79%), Glomeromycota (0.17%), Mucoromycota (0.1%), and Oomycota (0.06%). Fungi dominated in the community associated with asymptomatic saplings, while saprotrophs dominated in the soil of dead saplings. Fungal biodiversity was associated with tree species. No differences were observed between the pathogen fungi frequency in the fungal community of dead and living trees. Fusarium oxysporum was statistically significantly (p=0.019) associated with the containerized seedling group. The results showed that the fungal community of the soil samples under saplings from containerised production were more diverse than the ones produced in the traditional technology, hence it is advisable to use the planting stock with container−grown seedlings.
Keywords (EN)
  • Common beech

  • Common oak

  • crops

  • diversity of fungal community

  • Fusarium oxysporum

  • mycorrhizal fungi

  • saprotrophs

License
cc-bycc-by CC-BY - Attribution
Open access date
June 20, 2023
Fundusze Europejskie
  • About repository
  • Contact
  • Privacy policy
  • Cookies

Copyright 2025 Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu

DSpace Software provided by PCG Academia